sgrna生信分析
DNA测序的发展及其大规模应用促进?#21496;?#20934;医疗、个性化用药的发展。通过测序技术可在细胞之间比较某个基因的突变状态,但通常会有许多其它混杂的特征信息掩盖基因型和疾病类型之间的直接关系。近年来,随着CRISPR-Cas9基因编辑技术的成熟与普及,?#33455;?#20154;员可以编辑活体细胞基因组,精确地改变DNA序列,最终为开发出人类遗传疾病的新疗法奠定基础。

泓迅科技针对CRISPR-Cas9基因编辑技术,提供专业的sgRNA生物信息学服务。通过sgRNA序列设计,人工合成并成功进行基因敲除后,对测序结果进行基因表达谱分析、染色体DNA拷贝数统计等,最终实现从sgRNA设计、合成到功能分析的一体化服务。

泓迅科技拥有成熟一流的DNA合成技术和经验丰富的生物信息工程师,可根据?#31361;?#20855;体需求,定制生物信息学数据分析服务。我们能够结合PRECOG、TCGA以及COSMIC等专业数据库,分析筛选基因表达高低信息、基因突变频率信息、预临床后相关性数据,进行整合性生物基因组学分析,为潜在药物靶点和个性化医疗提供解决方案。同?#20445;?#36824;可以辅助?#33455;?#20154;员?#19994;?#20854;它可以作为治疗性靶点的附加基因。

sgRNA一体化服务流程:

服务优势:

1.丰富的CRISPR-Cas9 sgRNA设计经验,覆盖13种模式物种,可针对具体需求个性化设计。
2.专业的生物信息学服务团队,科学的方案设计,深入的数据挖掘,安全灵活的数据报告?#23454;?#26041;式。

应用领域:

农业、微生物、环境学、海洋学、人体微生态等

泓迅案例:

  • 实验方案整体描述:
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    用携带sgRNA的CRISPR-Cas9文库病毒感染细胞,对经过文库筛选后不同时期的细胞基因组进行二代测序。首先对sgRNA进行敲除效果评价,其次通过分析、比较,获得被富集或缺失的基因,进行GO,KEGG等功能注释,从而筛选出对细胞生存或者药物作用所必需的基因和靶点,最后结合已有的癌症数据库、突变数据库等信息,对靶点的信息进一步分析。

  • 结果展示:
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    sgRNA的基因敲除效果评价 sgRNA敲除后对基因表达的影响
    sgRNA的基因敲除效果评价
    sgRNA敲除后对基因表达的影响

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     sgRNA敲除后对信号通路的影响 挖掘潜在药物靶点
    sgRNA敲除后对信号通路的影响
    与TCGA数据库的数据结合,挖掘潜在药物靶点

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    sgRNA对基因外显子的敲除位点分析

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    服务详情:

    服务名称 分析内容 分析软件 交付周期 交付项目 价格
    sgRNA生物信息学服务 基因组,转录组,药物靶点挖掘等 R software 7-10 天 分析报告 询价

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